2015, le SHIELD n’est plus. Dissout par HYDRA, cette organisation terroriste qui avait donné tant de fil à retordre à nos héros Avengers. Il renaît désormais en tant que PROA2C (Protection & Research Organization Atypical Criminal Cases) mais les effectifs restent faibles. Alors que le calme regagne peu à peu la ville de New York, le bruit court qu’un nouveau recrutement de super-héros est en train de se faire. « Les Thunderbolts », avec à leur tête Norman Osborn qui revêt l’armure d’Iron Patriot. Publiquement décidés à repentir, ils ont en réalité de sombres projets. Leur but ? Faire couler les Avengeurs. Leur stratégie pour y arriver ? Montrer que les Avengers ne sont plus les grands protecteurs qu’ils se revendiquent être. Que se passera-t-il lorsque l’on apprendra que le petit Spider-Man a attaqué l’un des leurs alors qu’il s’efforçait à faire le bien ? De leur côté les Avengers forment de futurs nouveaux membres et essayent de percer à jour ce mystère que sont les Thunderbolts, ces inquiétants « repentis ». D’anciens vilains qui ont changé de camp ? Ils n’y croient pas une seule seconde et sont prêts à prouver que leurs intentions ne sont pas aussi bonnes qu’ils le clament haut et fort. Quant à Magnéto, pour lui les choses sont claires. Sa confrérie ne se liera à personne dans cette bataille. Ils ont leur propre équipe et aspirent à un tout autre but qui n’a guère changé depuis le début, l’éradication de la race humaine. Un chaos inévitable s’apprête à embrasser la ville. Nombreuses sont encore les personnes qui, désabusées face à ces guerres de la gloire, décident de s’écarter et de ne vivre que pour elles. Mais la question est de savoir de quel côté penchera votre balance…